La perforación en el área de desecho del material y la "entrada" a la geometría real para cortar es un procedimiento operativo estándar en la mayoría de las aplicaciones de chorro de agua. Esto evita colocar una gran imperfección por explosión de la perforación inicial en la superficie de la pieza. Al final de un corte, es posible que se requiera una salida para quitar cualquier "punta" del área de entrada.

Se pueden experimentar varios tipos de entradas y salidas para diferentes materiales y espesores. La Figura 9 muestra algunos ejemplos de entradas y salidas.